Les Présidents de la République sont les héritiers de Napoléon comme tuteurs des Maisons d'éducation. Ils veillent à leur bon fonctionnement par l'intermédiaire des Grands Chanceliers de la Légion d'honneur. Les statuts des Maisons ont plusieurs fois été modifiés. Aujourd'hui, tous les professeurs viennent de l'Éducation Nationale et suivent les mêmes programmes que tous les lycées et collèges de France.

A Saint-Denis, l'édifice du 18ème siècle a fait l'objet d'une restauration et d'une modernisation récentes. Entre 1983 et 1985, les architectes Costantini et Regembal y ont adjoint un nouveau bâtiment scolaire, à demi enterré, et regroupant les enseignements généraux et technologiques du secondaire. Cette sorte d'école-jardin contient des salles très fonctionnelles donnant sur des patios, tandis que l'ancienne abbaye est entièrement occupée par les dortoirs, le service des repas, les bureaux de Surintendance et d'Intendance, les classes post-baccalauréat et la bibliothèque des élèves.

Ainsi, ces espaces ordonnés et silencieux conçus pour des moines, puis consacrés par Napoléon à ses Maisons d'éducation, constituent toujours des demeures idéales pour le travail. Ils sont aujourd'hui le cadre de traditions renouvelées chaque année comme le Concert du Président de la République ou la Distribution des Prix et accueillent aujourd'hui des jeunes filles qui enfilent aussi bien les gants blancs qu'elles manient le clavier et la souris.